Hämeenkylmänkukka on uhanalainen harjukasvi, joka harvinaistui aikanaan runsaan keräämisen vuoksi. Jäljelle jääneet kasvustot ovat vähentyneet harjujen heinittymisen vuoksi. Paljon valoa vaativana kasvina hämeenkylmänkukka on jäänyt muiden kasvien varjoon, jossa se ei menesty. Hämeenkylmänkukka on rauhoitettu.